Zoller è entrato a far parte del Salzburger Landesskiverband all'età di undici anni. Fin da subito si è concentrato sulle discipline tecniche dello slalom e dello slalom gigante. Successivamente è stato ammesso nella rosa giovanile dell'Associazione Austriaca di Sci e dopo alcuni anni nelle squadre C e B, è stato promosso in A all'inizio degli anni '80. La sua prima apparizione in Coppa del Mondo fu il 5 gennaio 1978 nello slalom di Oberstaufen . Per il momento non ha raggiunto i punti nelle sue poche presenze in Coppa del Mondo. In Coppa Europa ottiene le sue prime due vittorie nello slalom di Mellau e nello slalom gigante di Villach nella stagione 1980/81 . Nel prossimo inverno ha festeggiato due vittorie nelle due di Coppa Europa slalom di Mehlmeisel e quindi ha fatto in nazionale ÖSV. Nella maggior parte della stagione 1982/83, invece, cadde a causa di un grave infortunio al ginocchio (strappo del legamento collaterale e crociato) subìto in allenamento.
In inverno del 1983-1984 Zoller anche reso al top nella Coppa del Mondo. Il 20 dicembre 1983, con il numero 38 di partenza alto, raggiunse il secondo posto nello slalom della 3-tre di Madonna di Campiglio dietro lo svedese Ingemar Stenmark e conquistò così i suoi primi punti in Coppa del Mondo. Tuttavia , non è riuscito a unirsi alla squadra per le Olimpiadi invernali nel febbraio 1984. Due settimane dopo le partite perse, ha vinto la sua prima e unica gara di Coppa del Mondo nello Slalom di Vail , seguito da un sesto posto di slalom a Oslo alla fine di marzo, portandolo all'ottavo nella Coppa del Mondo di slalom nella stagione 1983/84. Nella stagione 1984/85 Zoller ha ottenuto tre primi 10 posti a dicembre e gennaio negli slalom di Sestriere , Madonna di Campiglio e Wengen , che gli hanno assicurato un posto da titolare ai Mondiali del 1985 a Bormio . Lì ha vinto la medaglia di bronzo in slalom alle spalle dello svedese Jonas Nilsson e Marc Girardelli, partito per il Lussemburgo . A fine stagione, con il terzo posto nello slalom della Valle Celeste , è riuscito anche a conquistare un podio in Coppa del Mondo, a pari merito con l'italiano Alex Giorgi, dodicesimo in Coppa del Mondo di Slalom. Nella stagione 1985/86 Zoller non riuscì a eguagliare i risultati dell'anno precedente a causa di un infortunio. Il suo miglior risultato è stato settimo nello slalom di Lillehammer . Alla fine dell'inverno si ritirò dalla Coppa del Mondo e prese parte a gare professionistiche fino al 1989. Zoller ha completato la sua formazione come maestro di sci certificato statale e ha assunto la direzione di una delle due scuole di sci a Mühlbach am Hochkönig. Lavora anche come allenatore negli Austria Racing Camps di Hugo Nindl .
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