Reoviridae

Reoviridae
Rotavirus.jpg

Rotavirus nel TEM

sistematici
Classificazione : Virus
Regno : Riboviria
Impero : Orthornavirae
Phylum : Duplornaviricota
Classe : Resentoviricetes
Ordine : Reovirals
Famiglia : Reoviridae
Caratteristiche tassonomiche
Genoma : dsRNA segmentato
Baltimora : Gruppo 3
Simmetria : icosaedrica
Copertina : no
Nome scientifico
Reoviridae
Sinistra
 Tassonomia NCBI : 10880
Viralzone ( ExPASy , SIB): 104
Storia dei taxon ICTV : 201904871
Codice del virus ICTVdB : 00.060

I Reoviridae formano la più grande famiglia di virus senza involucro con RNA a doppio filamento (dsRNA). Insieme al Birnaviridae e Partitiviridae , sono gli unici virus il cui genoma dsRNA è segmentato. La famiglia comprende agenti patogeni importanti come il virus della febbre catarrale degli ovini , il rotavirus umano e il virus della febbre da zecca del Colorado . È il nome della famiglia di un acronimo di " r espiratory, e nteric, o rphan ", perché si è ritenuto che i membri di questo gruppo tassonomico solo Bowel Disease ( enterico ), malattie respiratorie ( respiratorie ) o nessuna malattia ( orfano ) causerebbe. In effetti, i Reoviridae sono stati trovati in molti mammiferi , oltre a rettili , pesci , crostacei e insetti . Tre generi della famiglia ( fijivirus , phytoreovirus e oryzavirus ) includono patogeni nelle piante ( virus delle piante ) e funghi ( micovirus ).

morfologia

Disegni schematici di virioni di diversi generi di Reoviridae

Le particelle virali mature (virioni) dei Reoviridae sono capside icosadrici non avvolti con un diametro di circa 60-80 nm. Caratteristica della maggior parte dei generi della famiglia (ad eccezione del genere Cypovirus ) è la struttura del virione di due e capsidi strettamente interagenti ( T = 13 ), che a loro volta circondano una struttura interna regolare del nucleo. I virioni, formati da tre strati di proteine , mostrano quindi una struttura molto tipica a pareti spesse con ispessimenti regolari a forma di raggio al microscopio elettronico . Derivato da questa struttura a raggi , il genere Rotavirus (lat. Rota : ruota) ha preso il nome. Questa struttura a raggi è creata da 132 aperture nel capside esterno, che si aprono nello stesso numero di canali nel capside interno. Questi canali, che si estendono al nucleo interno, consentono agli ioni di diffondersi nel virione.
Poiché il nucleo interno e il capside interno sono responsabili del corretto confezionamento dei segmenti di RNA, il capside esterno può avere una variabilità relativamente ampia delle strutture superficiali senza compromettere la stabilità del virione e la completezza del genoma. Pertanto, molti reovirus mostrano numerose specie e sierotipi .
Nel guscio del nucleo interno c'è una molecola della RNA polimerasi virale e della guanil transferasi . In alcuni generi, i residui miristilici ( residui tetradecilici) sono legati covalentemente al capside. I generi Rotavirus , Orbivirus e Coltivirus verifica virioni immature che hanno residui di un'involucro lipidico. In questi generi, le cellule lasciano la cellula germogliando sulla membrana cellulare ( orbivirus , coltivirus ) o sulla membrana del reticolo endoplasmatico (ER) ( rotavirus ). I virioni perdono nuovamente l'involucro lipidico attraverso una fase di maturazione enzimatica . In alcuni generi, il capside esterno viene modificato dalle proteasi dell'ospite (ad esempio tripsina , chimotripsina ), che creano le cosiddette " particelle subvirali infettive " (ISVP). Solo gli ISVP sono infettivi e il passaggio dai virioni immaturi agli ISVP gioca un ruolo decisivo nello sviluppo della malattia e nelle diverse manifestazioni dei virioni nell'intestino , nella saliva o nel siero del sangue .

Genoma

Mappa del genoma del genere Rotavirus
Mappa del genoma del genere Mycoreovirus

Il genoma è costituito da un RNA a doppio filamento, che è diviso in 10-12 segmenti a seconda del genere. La massa molare dei segmenti varia da 0,2 a 3 × 10 6  Da . L'mRNA virale di Reoviridae non ha una coda poli-A . In alcune specie di virus, brevi oligonucleotidi di RNA a filamento singolo si trovano nel guscio del nucleo interno.

sistematici

Sistema interno

A partire da novembre 2018, secondo l' ICTV, i Reoviriridae sono così suddivisi (oltre alla specie tipo, viene fornita solo una selezione di altre specie):

  • Famiglia Reoviridae
  • Virus Macropipus depurator P (MdRV-P, DpPV)
  • Virus Carcinus mediterraneus W2 (CmRV-W2, CcRV-W2)
  • Specie Micromonas pusilla reovirus (en. Micromonas pusilla reovirus , MpRV, specie tipo)
  • Virus Kemerovo (en. Virus Kemerovo, KEMV)
  • Specie virus del tumore della ferita (WTV, specie tipo)
  • Specie Rice dwarf virus (RDV)
  • Specie Rotavirus A (RVA, specie tipo)
  • BoRV-A / Regno Unito
  • SiRV-A / SA11
  • Specie Rotavirus B (RVB)
  • Hu / MuRV-B / IDIR,
  • Specie Rotavirus C (RVC)
  • PoRV-C / Co
  • Specie Rotavirus da D a I.
  • Specie Banna virus (en. Banna virus , BAV, specie tipo)
  • Specie Liaoning virus (s. Liao ning virus , LNV)
  • Specie Kadipiro virus (en. Kadipiro virus , KDV)
  • Specie aquareovirus A (specie tipo)
  • Specie acquareovirus B
Ricostruzione Cryo-EM di un virione GCRV
  • Specie acquareovirus C
  • Golden shiner reovirus (GSRV)
  • Reovirus della carpa erbivora (GCRV)
  • Specie aquareovirus E
  • Specie aquareovirus G
  • Specie Cypovirus 1 (specie tipo)
  • Specie Cypovirus da 2 a 16
Ricostruzione Cryo-EM di un virione " fakovirus "
  • Specie Aedes pseudoscutellaris virus (en. Aedes pseudoscutellaris virus , ufficialmente Aedes pseudoscutellaris reovirus , APRV, tipo specie)
  • Specie " fakovirus " (suggerimento)
  • Specie Virus della malattia delle Fiji (specie tipo)
  • Specie Idnoreovirus 1 (specie tipo)
  • Specie Idnoreovirus da 2 a 5
  • Specie Mycoreovirus 1 (specie tipo)
  • Specie Mycoreovirus 2 e 3
  • Specie Ortoreovirus dei mammiferi (MRV, specie tipo)
  • Specie Virus delle acrobazie sfilacciate di riso (RRSV, specie tipo)
  • Specie Echinochloa virus acrobatico sfilacciato
Specie virali non classificate all'interno della famiglia Reoviridae:
  • SsReV-SZ (SZ-2007) nei granchi nuotatori del genere Scylla (specie Scylla serrata, granchio di fango inglese )

Il seguente cladogramma fornisce una rappresentazione semplificata delle relazioni familiari come descritto nel 9 ° Rapporto dell'International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV, 2011) e da MacLachlan / Dubovi (2016); così come quasi costantemente da Belhouchet et al. (2010) ha suggerito:

 Reoviridae 
 Sedoreovirinae 

Mimoreovirus (MPrV)


   

Orbivirus ( SCRV , CHUV , AHSV , BTV , KEMV , TRBV , EHDV )


   

Phytoreovirus (RDV)


   


Seadornavirus (LNV, KDV, BAV)


   

Cardoreovirus (ESRV)



   

Rotavirus (RVA, RVB, RVC)






 Spinareovirinae 


Aquareovirus


   

Orthoreovirus (MRV)



   

Idnoreovirus


   

Oryzavirus (RRSV)


   

Dinovernavirus (APRV)


   

Cypovirus




   

Fijivirus


   

Coltivirus ( EYAV , CTFV )


   

Mycoreovirus




Modello: Klade / Manutenzione / 3



Modello: Klade / Manutenzione / Stile

Per alcune delle specie di generi, vengono specificati i nomi abbreviati, ciascuno include uno o più dei ceppi esaminati associati ( ceppi inglesi ).

Negli studi precedenti ci sono ancora alcune deviazioni (ad esempio in Attoui et al. (2006), Quito-Avila (2011) e Ke et al. (2010).

Sistema esterno

Con la Master Species List n. 35 di marzo 2020, l' ICTV ha assegnato i Reoviridae al Phylum Duplornaviricota di nuova creazione . Un cladogramma può essere trovato su Picornavirales §ICTV Master Species List # 35 .

gonfiarsi

  • PPC Mertens, C. Wei, B. Hillmann: Famiglia Reoviridae. In: CM Fauquet, MA Mayo et al. : Ottavo rapporto del Comitato internazionale sulla tassonomia dei virus. Londra, San Diego 2004, pagg. 447-555.
  • S. Mordrow, D. Falke, U. Truyen: Molecular Virology. 2a edizione, Heidelberg / Berlino 2003, ISBN 3-8274-1086-X .

link internet

Prove individuali

  1. ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL # 34, febbraio 2019
  2. ↑ a b c d e ICTV: Bluetongue virus , EC 51, Berlino, Germania, luglio 2019; Ratifica e-mail marzo 2020 (MSL # 35)
  3. ↑ ICTV : Master Species List 2018a v1 MSL inclusi tutti gli aggiornamenti sui taxa dalla versione 2017. Autunno 2018 (MSL # 33)
  4. ↑ a b c d e f ICTV : dsRNA Viruses: Reoviridae , in: ICTV 9th Report (2011), 9th report of the ICTV as a book
  5. ↑ SIB: Orbivirus , su: ViralZone
  6. ↑ SIB: Cypovirus , su: ViralZone
  7. ↑ NCBI: virus Fako (specie)
  8. ↑ SIB: Orthoreovirus , su: ViralZone
  9. ↑ Kelly Simone Bateman et al. : Una revisione tassonomica dei virus che infettano i crostacei con un'enfasi sugli ospiti selvatici. In: Journal of Invertebrate Pathology. 147, gennaio 2017, doi: 10.1016 / j.jip.2017.01.010
  10. ↑ N. James MacLachlan, Edward J. Dubovi: Fenner's Veterinary Virology. 5a edizione 2016, ISBN 978-0-12-800946-8 , doi: 10.1016 / C2013-0-06921-6 .
  11. ↑ Mourad Belhouchet et al. : Sequenza completa del virus Great Island e confronto con le proteine ​​T2 e del capside esterno dei virus Kemerovo, Lipovnik e Tribec (genere Orbivirus, famiglia Reoviridae). In: Journal of General Virology. 91 (Pt 12): pp. 2985-2993, dicembre 2010, doi: 10.1099 / vir.0.024760-0
  12. ↑ Houssam Attoui et al: Micromonas pusilla reovirus: un nuovo membro della famiglia Reoviridae assegnato a un nuovo genere proposto (Mimoreovirus). In: Journal of General Virology. 87 (Pt 5), pp. 1375-1383, giugno 2006, doi: 10.1099 / vir.0.81584-0 .
  13. ↑ Diego F. Quito-Avila et al. : Sequenza completa e caratterizzazione genetica del virus latente Raspberry, un nuovo membro della famiglia Reoviridae. In: Virus Research. Volume 155, n. 2, febbraio 2011, pagg. 397-405, doi: 10.1016 / j.virusres.2010.11.008 .
  14. ↑ FJ Ke, LB He et al .: Genoma del reovirus del rombo chiodato (SMReV) che codifica per una proteina FAST con un sito di inizio non AUG. In: BMC Genomics. 2010, doi: 10.1186 / 1471-2164-12-323 .
  15. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , New MSL compresi tutti gli aggiornamenti sui taxa dalla versione 2018b, marzo 2020 (MSL # 35)